國(guó)務(wù)院臺(tái)灣事務(wù)辦公室是根據(jù)1988年9月9日第21次常務(wù)會(huì)議決定成立的國(guó)務(wù)院辦事機(jī)構(gòu)，是國(guó)務(wù)院直屬事業(yè)單位。1991年3月國(guó)務(wù)院機(jī)構(gòu)改革決定，國(guó)務(wù)院臺(tái)灣事務(wù)辦公室與中共中央臺(tái)灣工作辦公室一個(gè)機(jī)構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機(jī)構(gòu)序列。該辦公室遵循黨中央和國(guó)務(wù)院制定的方針、政策，負(fù)責(zé)管理、指導(dǎo)、協(xié)調(diào)國(guó)務(wù)院有關(guān)部門(mén)和省、市、自治區(qū)人民政府在經(jīng)濟(jì)、科技、教育文化等方面涉臺(tái)事務(wù)；對(duì)各部門(mén)、各地區(qū)貫徹執(zhí)行中央、國(guó)務(wù)院方針、政策的情況進(jìn)行督促檢查，組織制定涉臺(tái)事務(wù)的有關(guān)政策、規(guī)定。

　　國(guó)臺(tái)辦主要職責(zé)

　　1、研究、擬訂對(duì)臺(tái)工作方針政策;貫徹執(zhí)行黨中央、國(guó)務(wù)院確定的對(duì)臺(tái)工作的方針政策。

　　2、組織、指導(dǎo)、管理、協(xié)調(diào)國(guó)務(wù)院各部門(mén)和各省、自治區(qū)、直轄市的對(duì)臺(tái)工作;檢查了解各地區(qū)、各部門(mén)貫徹執(zhí)行黨中央、國(guó)務(wù)院對(duì)臺(tái)方針政策情況。

　　3、研究臺(tái)灣形勢(shì)和兩岸關(guān)系發(fā)展動(dòng)向;協(xié)調(diào)有關(guān)部門(mén)研究、草擬涉臺(tái)的法律、法規(guī),統(tǒng)籌協(xié)調(diào)涉臺(tái)法律事務(wù)。

　　4、按照國(guó)務(wù)院的部署和授權(quán),負(fù)責(zé)同臺(tái)灣當(dāng)局及其授權(quán)社會(huì)團(tuán)體談判及簽署協(xié)議文件的有關(guān)準(zhǔn)備工作。

　　5、管理協(xié)調(diào)兩岸通郵、通航、通商事務(wù);負(fù)責(zé)對(duì)臺(tái)宣傳、教育工作和有關(guān)臺(tái)灣工作的新聞發(fā)布;處理涉臺(tái)的重大事件。

　　6、會(huì)同有關(guān)部門(mén)統(tǒng)籌協(xié)調(diào)和指導(dǎo)對(duì)臺(tái)經(jīng)貿(mào)工作和兩岸金融、文化、學(xué)術(shù)、體育、科技、衛(wèi)生等各個(gè)領(lǐng)域的交流與合作,以及兩岸人員往來(lái)、考察、研討等工作,國(guó)際會(huì)議的涉臺(tái)工作。

　　7、完成國(guó)務(wù)院交辦的其他任務(wù)。