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新竹古稱竹塹，清代易名新竹，1920年設新竹街，置街役場；1930年改制為巿，置巿役所；1941年合并香山莊全部及舊港、六家莊的一部分，擴大行政區域，下設二十五個區會協助推行巿政。1945年10月25日，臺灣行政長官公署接受日人臺灣總督之投降，11月5日公布各州接管委員會。新竹州接管委員于8日由主任委員率領到新竹，9日開始接收原新竹州機構，17日接收新竹巿役所，成立新竹巿政府，隸屬于接管委員會，11月30日將原日據時期設立的二十五區改為九區，同時接收原各郡役所。1946年1月接管委員會結束，成立新竹縣政府，暫借原新竹州廳辦公。新竹縣政府于2月28日遷往桃園，新竹巿亦因全省行政區域調整，正式設為省轄巿，成立新竹巿政府，下設東、西、南、北、竹東、寶山、香山等七個區公所，并遷入原州廳辦公室。整個臺灣省設五大縣、三小縣、九省轄巿，共計十七縣巿。
1950年4月22日，臺灣省當局公布地方自治實施綱要，10月25日調整全省行政區域，改設二十一縣巿，將原省轄新竹市和原新竹縣轄關西、新埔兩鎮、湖口、紅毛、竹北、橫山、芎林、北埔、峨眉等七鄉及尖石、五峰兩山地鄉等成立為新竹縣。縣治設于新竹巿，并將原新竹縣分設桃園、苗栗兩縣，縣治分設桃園、苗栗兩鎮。
1951年12月1日，原東、西、南、北等四區合并成立縣轄巿，新竹巿公所址置于中正路東區區公所，1955年夏遷入林森路原縣立中學。1982年7月1日起，原屬新竹縣之香山鄉并入縣轄新竹巿改制，新竹巿升格為省轄巿，省轄巿政府于1982年7月1日正式成立。1990年11月1日，新竹市下設東、北、香山等三個區公所，正式分區治事。
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