吳能遠還說到，海峽兩岸長期在兩岸間協議和共同制度的構建方面存在障礙，而海峽論壇正是掃清障礙的準制度化平臺；海峽論壇在構建兩岸制度方面有著卓越的貢獻，而且這樣的貢獻一年比一年突出。

　　在海峽論壇采訪期間，曾有臺灣代表向記者反映海峽論壇上的有些議題缺乏后續追蹤、較難落地的問題。對此，吳能遠建議，“在議題的選取上應突出特色，符合兩岸民眾的利益，并且每年的議題不建議設置太多，重點進行幾項有代表性、能讓民眾從中受惠的議題，才能確保論壇的影響更為深化、效果更為明顯。”(郭熙嬋)

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