陳云林對此笑笑表示，他在高鐵上看到了抗議人群，他可以容忍不同意見的人，也尊重他們的意見。

　　●兩岸交流互動已成為主旋律

　　“兩岸周”里的事情，均是為推動和深化兩岸交流。首次“經合會”被國臺辦發言人稱之為兩岸共同落實ECFA的重要一步、構建兩岸經貿領域制度化協商的新平臺、啟動了推動兩岸經濟合作發展的新機制。邵琪偉赴臺，則是為進一步擴大陸客赴臺游人數，并宣布適時推出島內業界最關心的赴臺個人游。

　　陳云林接下來的行程中，雖然仍有聲稱“如影隨形”的抗議人群，但人數越來越少。尤其是其南部最后一站云林縣，“獨派”原本聲稱要組織500人的抗議隊伍，實際只有20余人前來，反倒是云林縣在主會場擺放的“云林歡迎陳云林”的標語橫幅，隨處可見。

　　陳云林此行被看成是要為南臺灣解決產品滯銷和失業問題，讓綠營頓失抗爭目標，綠營也心知肚明，兩岸交流是大勢所趨，大陸還是南部農產品的重要市場，南部的縣市長們不但不拒絕與大陸交流，云林縣縣長蘇治芬還曾赴大陸推銷農產品。這些都使得綠營高層倍感糾結，一些綠營首長更私下要求“獨派”克制，因此，此次陳云林南下，綠營的抗議規模不如預期也在情理之中。有島內媒體表示，陳云林直接挺進南臺灣，有人向他抗議、嗆聲，有人卻擠破頭和他同桌、合照；面對部分綠營民眾隔空喊話的抗議聲，他只是笑笑，讓綠營人士無從發力，這可能也是兩岸交流的一大進步。